男性內褲上有血跡可能有以下原因：
1. 尿路感染：當尿路感染時，尿道黏膜可能充血、腫脹、滲血，導致內褲出現血跡。
2. 生殖器損傷：可能引起生殖器出血，從而導致內褲有血。
3. 腎結石：腎結石在體內游動劃破輸尿管和膀胱內壁，導致粘膜損傷，紅細胞進入粘膜內的分泌物排出體外，也會使內褲上有血。
4. 痔瘡：痔瘡患者可能有便血、肛門墜脹、疼痛等癥狀。外痔充血經過內褲摩擦有可能出血，從而使內褲上有血。
此外，還有可能是其他疾病導致的，如肛裂、腸道疾病等。如果內褲上的血跡持續存在或出現其他癥狀，建議及時就醫，進行相關檢查和治療。
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