卵巢囊腫5.5cm×4.0cm是否嚴重，需要根據囊腫的性質和患者的具體狀況來判斷。
1. 如果卵巢囊腫為良性，沒有出現明顯的不適癥狀，那么一般情況下并不嚴重。建議患者定期進行B超檢查，密切關注囊腫的變化，如果囊腫變大或出現不適癥狀，及時進行相應治療。
2. 如果卵巢囊腫是生理性的（例如黃體囊腫），那么通常不嚴重，可以自行縮小或消失。如果伴有痛經等癥狀，或者囊腫增大，需要及時進行手術處理，以免囊腫破裂。
3. 如果卵巢囊腫是病理性的（例如卵巢子宮內膜異位囊腫或卵巢炎性囊腫），可能會出現不孕、嚴重痛經、發熱等癥狀，這時較為嚴重。對于病理性的卵巢囊腫，如果增大或者懷疑有惡變可能，應盡早進行手術治療，并根據術中情況和術后病理檢查進行相應的輔助治療。
以上內容僅供參考，嚴重程度判斷需要結合個體自身狀況綜合判斷，建議咨詢專業醫生獲取更準確的信息。
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