同房后小肚子悶悶的不舒服可能是以下原因引起的：
1. 動作過于粗暴：同房時如果動作過于粗暴，可能會導致女性宮頸充血，男性陰莖充血，出現同房后小腹不舒服的情況。建議男性和女性半個月內禁止同房，同時通過毛巾熱敷、按摩等方法來緩解癥狀。
2. 慢性前列腺炎：如果男性患有慢性前列腺炎，同房可能會導致前列腺充血、腫脹，從而出現同房后小腹不舒服的情況。男性患者可以在醫生的指導下服用頭孢拉定片、硫酸慶大霉素片、左氧氟沙星片等藥物進行治療；也可以通過溫水坐浴、局部熱敷等方法來緩解癥狀。
3. 卵巢囊腫：如果女性患有卵巢囊腫，同房會刺激病變的部位，從而導致卵巢囊腫扭轉或者破裂，出現同房后小腹不舒服的情況。通常卵巢囊腫的治療以手術為主，女性患者可以通過卵巢囊腫剔除術、輸卵管卵巢切除術或者子宮切除術等方式進行治療。
以上信息僅供參考，不舒服的癥狀持續的話，建議及時就醫以獲取專業的診斷和治療。
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