六歲孩子不由自主搖頭的原因可能如下：
1. 不良習慣：有些孩子可能會因為不良習慣而無意識地搖頭。這種行為通常是無意識的，可以通過家長與孩子進行溝通，采用玩游戲、講故事等方式轉移注意力，逐漸緩解癥狀。
2. 營養不良：如果孩子挑食、偏食等不良飲食習慣，可能導致體內缺乏營養元素，進而出現搖頭現象。家長可以通過飲食調節，比如讓孩子多吃新鮮水果和蔬菜，補充身體所需營養，改善搖頭癥狀。
3. 抽動癥：這是由于情緒緊張、營養不良、身體代謝障礙、常染色體顯性遺傳等引起的。抽動癥患者可能會不由自主地搖頭，同時可能伴有其他癥狀，例如面部抽動、眼球運動等。對于抽動癥的治療，可以在醫生的指導下使用相應的藥物。
4. 正常現象：如果天氣炎熱，孩子穿的衣服多，導致身體出汗，也可能會出現搖頭的癥狀。此時，家長可以給孩子減少衣物，改善癥狀。
需要注意的是，六歲孩子不由自主搖頭的具體原因需要結合孩子的實際情況進行判斷。如果孩子的搖頭癥狀持續時間較長或者伴隨其他癥狀，建議及時就醫，以便醫生根據具體情況進行診斷和治療。
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