聚肌胞注射可以用于治療扁平疣。扁平疣是由人乳頭瘤病毒感染引起的病毒性皮膚病，好發于青少年，故又稱青年扁平疣。大多數扁平疣突然出現，為米粒到綠豆大小扁平丘疹，表面光滑，呈圓形、橢圓形或多角形，質硬，正常膚色或淺褐色，界限清楚且數目比較多，散在分布或沿抓痕呈條狀分布，好發于面部前臂及手背等處，一般無自覺癥狀，偶有微癢，病程慢性有時可突然自然消退，但也有持續多年，愈后不留瘢痕。
聚肌胞是一個免疫調節劑，可以誘導體內產生干擾素，對多種病毒的治療都有很好的療效。聚肌胞注射通常作為扁平疣的輔助治療手段，也可以與其他治療方案聯合使用，如局部外用藥物，包括維A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，或者選擇物理方法，如二氧化碳激光、液氮冷凍等。
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