眼睛充血的原因有很多，可能是由于細菌、病毒侵入眼睛引起的感染，高強度的工作使眼睛過度疲勞，或者是身體內存有炎癥等。針對不同原因，需要使用不同的藥物進行治療。以下是一些可能的治療藥物：

1. 抗細菌藥物：如果眼睛充血是由細菌感染引起的，可以使用抗生素藥物進行治療，如四環素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、紅霉素眼藥膏等。
2. 抗病毒藥物：如果眼睛充血是由病毒感染引起的，比如角膜炎或結膜炎，建議在醫生的指導下使用阿昔洛韋滴眼液、更昔洛韋滴眼液等藥物進行治療。
3. 抗真菌藥物：如果眼睛充血是由真菌感染導致的角膜炎，可以遵醫囑使用氟康唑滴眼液等進行治療。
4. 抗炎藥物：如果眼睛充血是由于炎癥感染引起的，建議在醫生的指導下使用雙氯芬酸鈉滴眼液等藥物進行治療。
5. 滋潤眼睛的藥物：如果眼睛充血是由于長時間使用電子設備、環境干燥等原因造成的眼部疲勞，可以使用人工淚液、潤潔滴眼液等滋潤眼睛的藥物進行治療。

需要注意的是，以上藥物使用建議僅供參考，如果您的眼睛充血持續不減或者癥狀加重，強烈建議您及時就醫。在醫生的指導下進行診斷和治療，以免造成不良后果。