早晨起來深呼吸胸口疼可能是由于以下原因引起的：

1. 胸部外傷：如果胸部受到嚴重的撞擊，可能會導致肋間肌或胸肋關節出現損傷，局部紅腫、疼痛，深呼吸時胸口隨呼吸舒張和收縮，加重胸口疼的癥狀。此時應注意休息，并使用吲哚美辛片、阿司匹林腸溶片等藥物止痛消炎。
2. 胸膜炎：如果胸部受到分枝桿菌的感染，可能會導致胸膜炎，炎癥刺激下會出現充血、紅腫、分泌物增多的現象，導致患者早上起來深呼吸胸口疼，并伴有胸悶、咳嗽、哮喘等癥狀。此時可以遵醫囑使用阿莫西林片、布洛芬緩釋膠囊等藥物治療。
3. 肺結核：患有肺結核的患者，由于肺部的病灶的位置接近胸膜部位，發生病變時會對胸部產生牽拉疼痛，從而使患者在早上起來深呼吸的時候出現胸口疼的現象，還會伴有咳嗽、咳痰、咳血等癥狀。此時可在醫生指導下服用異煙肼片、利福平膠囊等藥物改善癥狀。
4. 肋軟骨炎：肋軟骨炎是一種肋軟骨慢性非特異性炎癥，呼吸時會使肋軟骨增大，從而出現胸部針刺樣的疼痛。建議遵醫囑予以醋酸地塞米松注射液、乙酰氨基酚片等藥物緩解疼痛。
5. 冠狀動脈粥樣硬化性心臟病：早上情緒過于激動可能會導致急性發作，出現早上起來深呼吸胸口疼的癥狀。可以遵醫囑使用硝酸甘油片、阿司匹林腸溶片等藥物治療。
6. 心包炎：多由慢性風濕病轉變而來，心肌細胞有不同程度的變性、壞死，可出現明顯的胸痛感，可因咳嗽或呼吸而加劇，從而表現為早上起來深呼吸胸口疼。此時需要臥床休息，可在醫生的幫助下進行心包穿刺以解除壓塞癥狀。伴有劇烈胸痛、發熱時，可遵醫囑使用吲哚美辛腸溶片、鹽酸哌替啶注射液等藥物。

以上信息僅供參考，建議及時去醫院就診，查明病因對癥治療。