嬰兒夜里睡覺搖頭可能有以下原因：

1. 濕疹：嬰兒的頭皮、外耳道等部位可能患有濕疹，導致局部瘙癢，嬰兒在睡覺時會通過搖頭來緩解瘙癢感。
2. 維生素D缺乏性佝僂病：維生素D缺乏可能導致神經異常興奮，使嬰兒在睡覺時出現搖頭表現。
3. 中耳炎：無論是急性中耳炎、化膿性中耳炎還是分泌性中耳炎，都可能引起嬰兒耳部不適，睡覺時會不自主地出現搖頭現象。
4. 腸道寄生蟲：例如腸道蛔蟲癥、腸鉤蟲病等，可能引起嬰兒睡覺時出現搖頭表現，同時可能伴有睡眠不安、哭醒等癥狀。
5. 生理性前庭系統發育不完善：嬰兒在三到四個月后，可能會出現搖頭、抓耳朵抓頭等情況，這是因為內耳中前庭發育還不夠完善。
6. 淺睡眠：嬰兒在淺睡眠時期，身體會有各種各樣的小動作，如微笑、身體抖動、搖頭等，這是正常現象，無需特殊干預。
7. 寶寶熱了：家長過度保暖，導致寶寶感覺過熱，可能會通過搖頭來緩解不適。

此外，還有可能是寶寶有皮膚問題，家長可以檢查寶寶是否有濕疹或者后腦勺等部位皮膚不舒服。同時家長需要檢查一下寶寶是否有耳部問題，例如在搖頭的時候是否有頻繁的抓耳朵動作，可能需要帶寶寶去耳鼻喉科面診。以上情況都有可能引起嬰兒睡覺時搖頭，家長應根據具體情況尋求醫生的幫助。