牙疼晚上特別疼的原因主要有以下三種：

1. 牙髓炎：這是由于冷熱刺激、放射到半邊臉都疼、自發疼等癥狀引起的，并且晚上疼得特別厲害。引起牙髓炎的原因有齲病、楔狀缺損、牙外傷、牙隱裂、畸形中央尖等。牙髓炎的治療方法主要是根管治療。
2. 智齒冠周炎：由于智齒沒有長出來，在牙齦和周圍的牙齦之間形成盲袋，容易引起食物嵌塞，長期刺激導致周圍的牙齦發炎，并且晚上疼痛比較明顯。智齒冠周炎的治療主要是局部的沖洗和上藥，可以配合口服消炎藥，等炎癥控制以后可以拔除。
3. 精神高度集中：白天患者可能會因為工作、學習、日常生活、娛樂活動等行為分散對牙痛的注意力，而晚上周邊環境比白天安靜，或者在睡眠時患者精神較為集中，對牙痛的感知更為明顯，即可表現為牙痛晚上更痛的現象。

以上就是牙疼晚上特別疼的幾種原因，建議及時就診，確定具體原因后進行針對性的治療以避免影響睡眠質量。