手指關節疼痛可能有以下原因：

1. 骨關節炎：由組織變性及積累性勞損引起，是一種最常見的關節病變。骨關節炎以手的遠端和近端指間關節，膝、肘和肩關節以及脊柱關節容易受累，而腕、踝關節則較少發病。
2. 骨質增生：手指關節疼痛、腫脹，關節內有骨性增長物（骨刺）。多發生在手指末端指關節，也可發生在手指之間的關節。增生性關節炎一般年齡較大，多在40歲以上首先出現在一個或幾個手指，隨之，累及其他手指。患病的關節可紅腫，疼痛。晨起關節僵直比較常見，可以比較重，但持續時間短，少于20分鐘。X線檢查有骨質增生表現。
3. 寒濕或勞傷：手指關節疼痛也可能是由寒濕或勞傷（如腱鞘炎等）引起的一般性關節疼痛。長時間從事手指工作的人較常罹患的腱鞘炎，由于肌腱摩擦而造成腱鞘發炎，產生疼痛。
4. 腱鞘炎：腱鞘炎是臨床上最為常見的手外科疾病之一，常見的腱鞘炎主要發生在拇指、中指以及手腕部位等。患者常自述關節活動不靈活，關節腫脹。

除上述原因外，類風濕關節炎等也可能導致手指關節疼痛。如果手指關節疼痛持續時間較長或者疼痛程度較重，建議及時就醫，以便醫生根據具體情況進行診斷和治療。