肛門異味重的原因比較復雜，常見的原因是肛腸疾病、肛門失禁、臭汗癥，具體如下：1、肛腸疾病：如痔瘡、肛裂、肛瘺，有可能造成排便后肛門擦拭不完全，即肛門處長期反復的殘便殘留，可能會使肛門出現異味；2、肛門失禁：可能造成大便非自主漏出，存儲在內褲和肛門周圍，造成嚴重異味；3、臭汗癥：此為肛門異味比較嚴重的原因，如腋臭是由于頂泌汗腺分泌的分泌物受細菌發酵產生的一種臭味，頂泌汗腺是大汗腺，其存在于腋窩、肛門、會陰等部位，不是所有部位都存在，但肛門處就存在頂泌汗腺，少數人可能會因為精神因素、精神狀態或其他隱私造成自主神經功能損害或功能異常，從而出現多汗癥，即肛門局部的頂泌汗腺分泌活動增加，排除更多的分泌物，分泌物受異常菌發酵產生肛門異味。也不能排除其他原因導致肛門異味重，具體需專業醫生予以專業檢查、判斷和決策。