若扁桃體增生未引起任何臨床癥狀，患者可以繼續觀察而無需進行任何治療。若患者在兒童時期出現扁桃體增生，屬于生理性增生，在未引起任何臨床癥狀的情況下，通常在患者10-14歲時扁桃體即可逐漸萎縮。若扁桃體增生較為明顯，達到Ⅲ度腫大，會引起患者出現咽腔狹窄、打鼾，尤其在打鼾過程中出現睡眠呼吸暫停綜合征，并且在白天嗜睡、困倦。在患者的兒童時期會影響智力發育，部分情況下會對患者的心臟、心腦血管等造成影響。此時需進行手術干預，將扁桃體切除。若扁桃體增生反復出現發炎而引起急性化膿性扁桃體炎，也應考慮將扁桃體切除。部分患者的長期低熱是由于慢性扁桃體炎導致，可能也需考慮將扁桃體切除以緩解癥狀。