肛裂是比較常見的肛腸科疾病，最常見原因和人體解剖因素有關系。一般肛裂容易發生在后正中位和前正中位置，側方位置肛裂發生較少，主要原因是因為人體肛門后部有肛尾韌帶存在，相對肌肉組織較少，延展性和松弛性比其它部位差，由于干硬大便或其它原因，容易造成肛門部的皮膚撕開，或小裂口，形成肛裂。還有各種原因的外傷，比如比較粗硬的大便，用力解大便時容易把肛門皮膚劃傷。有時做肛門指診時，因為肛門括約肌比較敏感，所以有時在沒有防備的情況下引起痙攣。此時如果暴力插入肛門，也容易造成肛管皮膚裂口。 由于肛竇炎、肛門周圍炎癥或者小裂口持續不愈合后，可以造成肛門的裂口持續存在。另外，其它的原因，比如生理學原因，懷孕和其它激素變化等都可以導致或誘發肛裂產生。