先天性心臟穿孔實際是非常嚴重的并發癥，先天性心臟穿孔的原因主要是先天性心臟病，如冠脈異位、大動脈轉位導致心肌供血不足，從而導致心臟穿孔。健康的心臟組織發生心臟穿孔，血液會從心臟穿孔的位置流到心包腔。心臟外圍裹了一層衣服，衣服和心臟之間有一層潤滑液叫心包腔，如果心包腔里有大量的血液，叫心包積血。心包腔沒有延展性，會壓迫心臟，導致心臟的搏動受限。心臟是血泵作用，需要將血泵到全身。如果收縮空間變小，血泵不能正常工作，不能滿足機體需求，很容易發生猝死，所以先天性心臟穿孔是一個待解決的問題。