皰疹性咽峽炎的治療如下：1、隔離：出現癥狀以后，先要進行隔離，因為此病是一種傳染病，要對病人用過的物件以及吃過的食物進行正確處理；2、降溫：對于高熱的患兒，要進行適當降溫，有物理降溫和藥物降溫，對于不能進食的病人，要進行適當補液；3、藥物治療：目前對于柯薩奇病毒和腸道病毒，沒有特異性的抗病毒藥，可以用干擾素α進行局部的噴霧治療。皰疹性咽峽炎是柯薩奇病毒和腸道病毒，引起的一種急性上呼吸道傳染性疾病。皰疹性咽峽炎通常在6歲以下兒童多見，成人也有散發。病人在臨床表現上，主要是有發熱，尤其是嬰幼兒可以高熱到39℃-40℃。多數比較大的兒童或成人，出現低熱或中等度發熱。嬰幼兒也可以表現為惡心、嘔吐等癥狀，疼痛非常明顯，病人通常可以出現咽峽部、懸雍垂等部位的皰疹。開始時是皰疹，1-2天就能夠破裂，一般在6-7天能夠逐漸愈合。此病一般在1周左右能夠痊愈，只有少數人可能會有并發癥。