男性腰疼可以掛以下科室：1、骨科：腰疼的原因常見的是腰部軟組織損傷，如腰椎脊柱的棘上韌帶炎、椎旁的肌肉筋膜炎、腰肌勞損。腰疼原因還有可能是腰椎間盤突出、腰椎滑脫、腰椎管狹窄等，都是骨科的常見疾病，因此首選骨科；2、泌尿外科：男性腰疼可能是泌尿系的病變，比如腰疼的部位在腰偏上，靠近胸廓下方，這個位置是腎臟的體表投影位置。如果有泌尿系結石、輸尿管結石、腎結石，可能會引起腰部疼痛，這時屬于泌尿科疾病，應該掛泌尿外科。照立位腹平片明確是否存在結石，必要時做膀胱鏡明確泌尿系統(tǒng)的病變，還可以做核磁共振檢查軟組織的情況，可以更好的明確診斷疾病。