男性肚子疼可以掛消化內科、普通外科、胃腸外科，部分大型醫院分科比較精細，如胃腸外科、結直腸外科。上腹疼痛可以去胃腸外科，右側上腹部疼可以去肝膽外科，下腹部疼可以在結直腸外科或肛腸外科就診。如果是急性的腹痛，劇烈、持續性的疼痛，腹痛難忍，可以掛急診科，急診科會根據肚子疼的情況請相關科室的會診，例如急腹癥就是肚子短時間內持續的劇烈疼痛，可以掛急診外科，急診外科可能會請肝膽外科、胃腸外科或結直腸外科進行會診，明確診斷，根據病因擇科住院治療。如果是非持續性輕微的疼痛，也可以自己到門診掛消化內科、胃腸外科、結直腸外科就診。