胃癌化療后的反應主要分為血液學毒性和非血液學毒性，血液學毒性是指骨髓抑制或肝腎功能損傷，通常可以通過實驗室的檢查指標發現異常。骨髓抑制包括白細胞減少、血小板減少、貧血等。非血液學毒性反應通常包括消化道反應、過敏反應、皮膚反應、神經毒性以及心臟毒性、脫發等。 不同化療藥物引起的不良反應不同，胃癌的化療藥物主要有鉑類、紫杉類、氟尿嘧啶類和伊立替康等。順鉑會引起惡心、嘔吐等消化道反應可能會相對明顯，目前臨床有很多預防性的止吐藥物，通過預防性處理，可以將不良反應降到最低水平。奧沙利鉑和紫杉類藥物可能會引起皮膚過敏反應，紫杉類藥物和伊立替康可引起脫發。另外，伊立替康還會引起遲發性腹瀉和急性膽堿能綜合征，需使用止瀉藥物。氟尿嘧啶類藥物主要的不良反應是心臟毒性，口服氟尿嘧啶可引起手足綜合征。不良反應的發生具有不同的機理，需使用不同的藥物和物理方法進行處理。