支原體感染后咳嗽可能是由于呼吸道炎癥刺激，導致呼吸道上皮細胞損傷，造成氣道高反應性咳嗽的敏感性增加，支原體感染引起的咳嗽特點多為陣發性的干咳，少數患兒會出現黏痰，痰中偶爾帶有血絲；隨著病程進展，咳嗽逐漸加重，個別患兒可能會出現類似百日咳的痙咳，甚至連聲咔咳。 百日咳感染后咳嗽需祛除病因，足療程應用大環內酯類抗生素來進行抗感染治療，同時可應用易坦靜、愈美顆粒等藥物進行止咳化痰的對癥治療，但不建議患兒應用中樞性的鎮咳藥，還可以用酮替芬或孟魯司特來降低咳嗽的敏感性、改善氣道的高反應性，對嚴重的、頑固性的感染后咳嗽的患者，在一般治療無效的情況下，可以短期使用吸入糖皮質激素以降低咳嗽的敏感性，改善氣道的高反應性；此外，感染后的咳嗽也具有一定的自限性，病程一般可持續2-8周。