先天性腎臟疾病不可治愈。部分病人通過治療可以臨床緩解，如Fabry病是代謝缺陷的疾病，主要是α-糖苷酶的缺陷。如對癥采取酶的替代補充治療，其指甲角化、腎臟的損害也能夠緩解。 多囊腎、多囊肝、Alport綜合征，或者薄基底膜綜合征，到目前為止還是無法通過藥物治愈。早期巨大囊泡，需要抽液改善腎小球囊腫的壓力。如有炎癥應及時控制囊腔感染，對腎功能的進展有一定好處。