孕酮和HCG既相互聯系也存在不同，孕酮可以反映黃體功能以及孕激素水平的情況，而HCG反映體內絨毛膜滋養層細胞分泌激素水平的高低，即在懷孕時HCG反映絨毛的活性如何。兩者反映的方面不同，但是兩者不是一點相關性也沒有。孕酮在正常懷孕時一般是呈現升高的情況，但如果胚胎發育異常，即HCG水平下降，胚胎活性異常的情況出現時，有可能影響到孕酮數值而出現孕酮下降。所以一般判斷胚胎發育的好壞，要結合血HCG和孕酮的激素水平進行共同判斷，任何一方下降，有可能表明胚胎質量出現異常。