宮外孕藥物治療，不存在排出孕囊的情況。宮外孕用藥后胚胎組織多數在輸卵管內，不會從宮腔掉出，因此用藥后不會排出孕囊，可能在著床的局部壞死、被吸收。部分孕囊接近輸卵管傘端，就可能在壞死后通過輸卵管傘端，掉入盆腔中，被盆腔腹膜所吸收。宮外孕通過藥物治療后會發生出血，因為藥物治療后胚胎會死亡，胚胎死亡后會造成子宮內膜脫落，從而導致出血。通常藥物治療后，應觀察絨毛膜促性腺激素(HCG)的值，用藥4-7天后，如果HCG下降超過15%，通常認為有效。如果下降沒有超過15%或者是未出血變化，甚至上升，可以認為此次藥物治療失敗，應選擇二次用藥，或者尋求外科手術治療。