TIPS手術后遺癥最典型的就是肝性腦病以及肝功能衰竭，如下所示：1、肝性腦病：TIPS的操作是經頸靜脈肝內門體分流支架植入術，主要是經過頸靜脈穿刺然后到達門靜脈，將門靜脈與肝靜脈進行支架放置。這種情況下門靜脈的血流就直接通過相應的內支架進入肝靜脈，從而直接進入腔靜脈回到心臟，主要能夠降低門靜脈的壓力。但相對應也減少了肝臟的供血，這種情況下血流直接進入了肝靜脈回流，沒有經過肝臟進行過濾。如果分流支架直徑較大，特別是＞10mm，往往很容易引起肝性腦病。因為一些毒性物質沒有經過肝臟代謝，很容易造成毒性物質的蓄積從而形成肝性腦病；2、肝功能的衰竭：肝臟也會因為缺乏血供、缺乏營養而容易出現肝功能的衰竭。所以TIPS一般只用于降低門脈壓，對于肝臟本身的愈合、恢復沒有用處，TIPS主要是用于肝移植前期的過渡治療。