新生兒心臟雜音二級能否自愈，取決于產生雜音的原因，需要咨詢專業兒科心血管醫生做出判斷，主要原因如下：1、生理性雜音：由于最常見的肺動脈瓣雜音，因為新生兒出生之后，肺血流大量增多后，肺血管相對狹窄，引起二級雜音，可能是生理性雜音，此種雜音通常可以自愈。因為隨著其年齡增大，其肺動脈便會增寬，增寬后雜音自然便消失了，即自愈；2、房間隔缺損：新生兒心臟雜音二級，見于部分房間隔缺損，如果缺損面積是8mm以內，房間隔缺損隨著年齡增長，自愈幾率也非常高，尤其3-4歲以內也有自愈的。但如果心臟二級雜音，是由于比較大的房間隔缺損引起，8mm、10mm或者十幾毫米的房間隔缺損引起，此種雜音自愈的可能性便相對較小；3、其他復雜先天心臟病：比如由于主動脈弓縮窄或者肺動脈狹窄引起的雜音，此種雜音自愈可能性便相對較小。