孩子發燒且頭疼常見以下幾方面原因：1、上呼吸道感染：常見于病毒感染，孩子可能伴發熱、打噴嚏、流鼻涕、鼻塞、咳嗽等臨床癥狀。由于病毒釋放的毒素，可能導致部分孩子出現頭疼、全身肌肉酸疼等癥狀。此時應積極進行抗病毒治療，同時給予對癥感冒治療后，由于體溫逐漸下降，頭疼癥狀將逐漸緩解；2、中樞神經系統感染：部分孩子可能伴化膿性腦膜炎、病毒性腦炎、結核性腦膜炎，表現為發燒、頭疼、惡心、嘔吐、嗜睡等癥狀，嚴重情況下可能出現昏睡、昏迷、抽搐發作。此時應及時前往醫院就診，進行血常規、頭部CT、核磁共振、腦電圖等檢查，同時進行腰椎穿刺術明確腦炎性質，從而進行針對性治療。隨腦炎癥狀控制后，發燒、頭疼的癥狀將隨之緩解。