臨床上輸尿管炎很少單獨發生，通常是腎盂腎炎和腎周圍感染的一部分，所以臨床表現和腎盂腎炎以及膀胱炎等臨床表現類似，主要的臨床表現為排尿的刺激癥狀，患者可能會存在尿頻、尿急、尿痛。其次患者會出現肉眼血尿，如果存在梗阻引起積水，會出現腰部疼痛癥狀，如果感染比較重，可能會出現發熱等全身癥狀。影像學檢查對輸尿管炎的診斷有一定幫助，尤其是急性炎癥，波及到輸尿管，引起穿孔、尿液外滲時，通過影像學檢查可以明確診斷。對于非特異性的輸尿管炎，它的臨床表現和泌尿系統其他部位感染類似，還有一些特異性的感染，包括輸尿管的結核、血吸蟲性的輸尿管炎，它們的臨床表現各有各的不同。臨床上最常見的是非特異性的輸尿管炎，通常要進行病因治療，應用抗生素處理，如果有梗阻，可以行相應的引流治療，甚至考慮行外科手術治療。