皰疹性咽峽炎的初期癥狀，主要是突然發熱并伴有咽痛、咳嗽、厭食、嘔吐、惡心、腹瀉等癥狀。由于皰疹性咽峽炎，主要發生在兒童、嬰幼兒，在嬰幼兒時有可能會由于劇烈的咽痛，而出現流口水、哭鬧、拒絕進食等。多數兒童存在低熱或者中度程度的發熱，但是部分兒童可能會出現高熱，甚至出現高熱驚厥，且由于咽痛比較明顯可能會影響吞咽。由于皰疹性咽峽炎主要是病毒感染引起，常見是柯薩奇A型病毒與腸道病毒71型。在治療方面，沒有絕對特異性的抗病毒治療，通常是對癥支持治療，適當補液以及維生素，注意水電解質平衡，也要注意保持口腔的衛生，可以用淡鹽水或者生理鹽水漱口，嬰幼兒可以擦拭口腔，預防進一步的感染。同時皰疹性咽峽炎有傳染性，所以要注意隔離，以免引起交叉感染。