肉蔻四神丸可以治療結腸炎，該藥主要治療脾腎陽虛導致的雞鳴瀉或五更瀉等，患者多在凌晨，天一亮時出現腹痛、腸鳴、腹部不適，需要上廁所，到廁所后會出現腹瀉，瀉完后腹痛、腹部不適、腸鳴等癥狀能夠得到較好緩解。此外，患者通常會有脾胃虛寒、腎陽不足的表現，如面色晄白、氣短乏力，平常穿的比別人多，稍微受涼則會出現腹瀉。而腹部會出現冷痛、喜暖喜按，在多穿衣服、多蓋被子后，腹部不適的癥狀能夠緩解。另外，患者還表現為腰酸乏力、舌淡、苔白、脈沉遲無力或者是脈沉細無力等，均屬于脾腎陽虛的表現，對于此類患者則可應用肉蔻四神丸進行治療。