骨骼及氣體較多的胃腸道、肺部則不適合超聲檢查。超聲檢查適用于實質性臟器，如肝、膽、胰、脾、腎、心臟以及血管。超聲檢查技術均歷經長時間磨練，目前隨著超聲技術的發展與進步，其他部位的檢查也正在處于開發研究階段。 現階段較為常見的肌肉、骨骼檢查；重癥醫學領域中的肺超聲檢查；以及在胃腸道放胃腸促排空藥物，胃腸道氣體排空后也可進行超聲檢查。隨著超聲檢查技術的不斷發展，現在不適宜做超聲檢查的部位越來越少。