慢性鼻竇炎藥物治療需要較長時間，經過規范治療復發率不高。對于藥物治療效果不好的慢性鼻竇炎，特別是合并鼻息肉、鼻腔結構異常，比如鼻中隔偏曲比較嚴重情況下，需要考慮手術治療。 目前鼻竇炎手術較好的方式是鼻內鏡下手術，也稱功能性鼻竇內窺鏡手術。鼻竇炎治療強調綜合治療，包括術前用藥、手術和術后用藥一系列措施，可以大大降低手術復發率，絕大部分患者可以治愈。但仍有部分患者在使用各種治療方法后仍難以治愈，稱為難治性鼻竇炎。這部分患者比率不超過10％，比如合并廣泛鼻息肉，合并哮喘，合并鼻腔、鼻竇組織中嗜酸性粒細胞增多等，是鼻竇炎容易復發的高危因素。這種情況在手術前、手術后要強調綜合治療，是保證手術效果的有力手段，也是降低鼻竇炎復發率的保證。