膝關節后方出現的骨窩囊腫治療方法多采取膝關節鏡的微創治療方式，并非之前做很大切口后把囊腫剝除，因為剝除骨窩囊腫復發率較高。通過微創膝關節鏡手術，在膝關節前方或者膝關節后方建立入路，將膝關節的骨窩囊腫壁刨除，并且將半月板損傷做相應縫合、修補，恢復后的效果比較好。隨著目前科學研究或者認識逐漸清晰化，膝關節半月板損傷后出現囊壁積液，久而久之會形成骨窩囊腫，因此骨窩囊腫與半月板損傷息息相關。因為形成不可逆的盲瓣，膝關節液體會積聚在骨窩囊腫中，通過膝關節鏡將囊壁剝除，并且把盲瓣去除，進行相應的半月板修補、縫合，可以從根本上將骨窩囊腫去除。