卵巢囊腫絕大部分不會影響生孩子，因為如果卵巢局部的囊腫功能正常，應然會周期性的分泌雌激素和孕激素，仍然會每個月有一個卵泡發育成熟，排出卵子，所以不影響生孩子。但是如果是巧克力囊腫的情況下，往往會影響生孩子。主要是因為巧克力囊腫通常會引起進行性加重的痛經，還會導致卵巢局部的卵泡壁變厚，影響排卵，所以在臨床上會導致影響生孩子。因此建議對于巧克力的囊腫，如果直徑＞4cm，可以考慮手術治療。在手術治療之后還要做后續的治療，比如用唯散寧(地諾孕素片)或者上曼月樂環(左炔諾孕酮宮內節育系統)，主要是預防期復發的可能性。因此如果計劃懷孕的情況下則可以在手術后盡快考慮懷孕。總之有一些卵巢囊腫會影響生孩子，有一些則不會影響。對于卵巢囊腫做手術要嚴格的掌握適應證和禁忌證，該做手術的絕不姑息，不該做手術的可以臨床動態觀察。