膽結石的原因較為復雜，一般與膽道感染、膽囊炎及膽固醇沉積或膽道梗阻等因素相關。膽結石首先與日常飲食息息相關，如部分年輕人不喜歡吃早餐，因為空腹時間較過長，可導致膽囊內膽汁過于淤積濃縮，膽道收縮功能不良造成膽囊結石形成。其次飲食習慣差，長期進食高膽固醇、高脂飲食，容易促進膽固醇過度飽和，導致膽汁成分變化，過多膽固醇會從膽中析出，從而形成膽結石。此外，部分血液系統疾病導致膽汁中非結核膽汁素升高，從而促進鈣離子與之結合形成膽色素結石。 發生膽結石后，手術治療僅能根除膽結石結局，并未解決發病因素，將膽結石隨膽囊切除，才能得以根治。