甲狀腺結節穿刺是診斷甲狀腺疾病的重要手段，通常良性1類或2類結節不推薦做穿刺，推薦做穿刺的是3類或4A、4B之類結節，即可疑惡性結節做穿刺。穿刺針和平時打針的針頭相同，疼痛是穿過皮膚時，穿入甲狀腺腺體以后不會很痛，具體痛感要根據個人耐受情況，絕大多數病人反饋不痛，但穿刺后可能會形成局部小血腫，導致局部可能有腫脹、不適感。穿刺過程中不會有明顯不適感，這是用細針穿刺。部分醫生為明確診斷可能會推薦用粗針穿刺，粗針針頭較粗，可能局部要打麻藥，疼痛感會比細針明顯。 部分病人很擔心穿刺腫瘤后會不會產生種植轉移，根據最新調查顯示，轉移幾率非常低，只存在百分之零點幾。若穿刺結果惡性，則需手術治療，因此影響不大，切掉整個甲狀腺后穿刺種植處也會被切除。