尿道感染最快的治療方法在于明確尿道感染的種類。尿道感染最常見的是細菌感染及其它微生物，如支原體、衣原體等感染。一般感染源不同，其處理方式也不一樣。如果是常見的葡萄球菌或者大腸桿菌造成的泌尿系感染，用對癥的抗菌素治療，效果比較好。但是若使用同樣的抗菌素治療支原體、衣原體類的感染，可能無法獲得好的臨床效果。 因此不同的病原體需采取不同藥物治療。此外，僅藥物治療不夠，患者也需養成多喝水、勤排尿的習慣。