對于后尿道的感染，通常是以抗生素治療為主，還可以遵醫囑服用對癥治療藥物1、抗生素治療：可以根據病原微生物的檢測結果進行選擇，同時結合藥敏試驗選擇合理的抗生素，目前在臨床上常用的藥物包括磷霉素氨丁三醇、匹美西林、呋喃妥因、喹諾酮類，以及第二代和第三代頭孢菌素。對于后尿道感染，也就是男性的尿道感染，通常以喹諾酮類應用更為多見。如果不能除外支原體和衣原體感染，應當加用多西環素或阿奇霉素；2、對癥治療藥物：后尿道感染應當及時處理，如果不處理，可能會引起男性生殖系統的感染，使治療復雜化。除抗生素的應用以外，還可以應用改善癥狀的藥物，如果后尿道感染引起生殖系統感染，導致排尿困難，可以加用α受體阻滯劑等藥物改善癥狀。如果有明顯的排尿刺激癥狀，可以應用黃酮哌酯類或M受體阻滯劑進行對癥處理；3、一般治療：在生活上要求患者多飲水、注意休息、避免勞累、暫停性生活，如果考慮存在性傳播問題，要求性伴侶同時進行檢查和治療，要求患者要處理好自己的隨身衣物、被褥等。