卵黃囊瘤的腫瘤學標志物是甲胎蛋白，甲胎蛋白較為特異，臨床上可幫助診斷卵黃囊瘤，常見關系如下：1、甲胎蛋白是診斷卵黃囊瘤的重要依據，如果骶尾部卵黃囊瘤患者出現大小便障礙，影像學檢查顯示局部有浸潤以及全身轉移病灶，且甲胎蛋白較高，有幾十萬，甚至上百萬的情況下，可進行臨床診斷，因此甲胎蛋白是診斷的重要依據；2、甲胎蛋白是觀察卵黃囊瘤治療療效的重要指標，腫瘤細胞活性越高，分泌的甲胎蛋白產物越多，即甲胎蛋白越高，說明腫瘤細胞活性越強，經治療后如果甲胎蛋白呈指數下降，說明治療較為有效；3、甲胎蛋白是判斷卵黃囊瘤患者預后的指標，如果甲胎蛋白增高，不超過100μg/L，說明預后較差；4、甲胎蛋白是判斷卵黃囊瘤復發的重要依據，患者治療結束后，隨訪觀察中甲胎蛋白有升高的情況，要警惕經常出現上述情況的患者，需要進行動態觀察。如果甲胎蛋白持續增高，提示有腫瘤復發的可能，需進行相應的影像學檢查，尋找是否存在復發灶。