兒童尿道下裂原因復雜，當今醫學界尚未了解完整的導致疾病發生的過程。原因可能如下： 1、在陰莖發育過程中，出現發育停滯導致尿道下裂，包括尿道下裂的包皮帽狀堆積、尿道開口異常，以及嚴重的陰莖下彎； 2、現在研究發現胎兒時期的內分泌改變，導致某個時期陰莖發育停滯，導致患者出生后尿道下裂。如試管嬰兒尿道下裂發生率高，因為母親孕期用黃體酮保胎。有些高齡孕婦機體功能衰退、內分泌紊亂，可能導致孩子尿道下裂概率相對較高。 尿道下裂主要特征為尿道開口異常、陰莖下彎以及包皮帽狀堆積，外觀不良，患者手術最佳年齡為6-18個月。