如果甲胎蛋白(AFP)升高，達到200μg/L，患者既往又有慢性乙型肝炎或者丙型病毒性肝炎，影像學也提示有肝癌陽性表現，這時肝癌的可能性＞90%，基本上就可以診斷為肝癌。甲胎蛋白(AFP)跟肝癌有著密切關系，在臨床診斷中甲胎蛋白(AFP)是重要的參考指標，除了甲胎蛋白(AFP)數值外，醫生可能還會考慮患者是否有肝炎的背景，如既往有乙型病毒性肝炎、丙型病毒性肝炎，肝炎、肝硬化、肝癌是肝癌發生的三部曲。醫生可能要結合影像學表現，選擇做增強CT或者增強磁共振，來明確肝臟腫塊的情況，判斷肝癌腫塊的大小、多少，有無肝癌快進快出的表現。有些患者雖然甲胎蛋白(AFP)升高，但是并沒有肝癌的典型表現，這時需要排除是否存在甲胎蛋白(AFP)升高的其他因素，如妊娠或者生殖系統疾病的患者也會導致甲胎蛋白(AFP)升高，需要進一步鑒別。