肝癌誤診幾率較小，尤其對于晚期肝癌患者，通常影像學已經可以確診，多數未必需要通過病理學診斷，可以根據患者既往臨床病史，有無合并肝炎病毒感染、長期飲酒和肝硬化，再通過腫瘤標志物甲胎蛋白檢查，配合影像學增強CT及增強核磁，基本可以進行臨床確診。部分小肝癌、早期肝癌或不典型肝癌易與其他肝臟良性占位性疾病混淆。對于確診肝癌患者，更重要的是避免將肝癌誤診成為良性疾病延誤診斷，患者需根據腫瘤臨床分期盡快采取相應治療，輾轉于不同醫院重復檢查，反而不利于疾病控制，可能延誤疾病治療。對于不確定或無法確診的肝癌，必要時可通過進一步影像學檢查，包括全身PET-CT或腫瘤穿刺活檢檢查，以鑒別原發性及轉移性。