患者由于肛裂上廁所疼痛，可以使用一些緩解疼痛的藥膏，減輕由于疼痛而引起的排便困難。常用的藥膏包括復方利多卡因乳膏、復方甘菊利多卡因凝膠，患者在上廁所前10分鐘將其擠入肛門內，具有止痛的作用，幫助順利排便，但僅能起到暫時的作用。還需針對肛裂進行治療，可以使用一些促進創面愈合、治療肛裂的藥膏，如太寧軟膏、馬應龍痔瘡膏、銀離子痔瘡凝膠、祛腐生肌膏等。另外，需針對肛裂發生的原因進行治療，若由于便秘引發，可以服用治療便秘的藥物，如乳果糖、福松粉等，以及多飲水調理和糾正便秘。若由于肛門括約肌痙攣引發，可以在肛門周圍的肌肉注射肉毒素，解除肛門括約肌的痙攣，肛裂可逐漸痊愈。若為陳舊性的肛裂，經過藥物治療仍效果欠佳，則進行手術治療。