結腸鏡檢查指利用一根前端裝有鏡頭的軟管，將軟管通過肛門順到腸壁里去檢查，從右下腹的回盲部，就是盲腸、升結腸到橫結腸、降結腸、乙狀結腸，最后是直腸。常見的是從肛門進去，從直腸往上走一直到盲腸和回盲段，走到最里面后再退回去進行檢查，看盲腸、升結腸、橫結腸，降結腸、乙狀結腸，到底有無病變，再退進去觀察。所以軟管插管的過程中，可能會感覺不舒服，但是大多數人可以耐受。現在腸鏡技術也很先進，不會感覺太疼，但是對于比較瘦弱的患者或者做過手術的患者有術后粘連，尤其是做過婦科手術的人會比較疼痛。如果害怕腸鏡檢查引起疼痛，可以做無痛的腸鏡檢查，在全麻下可以做腸鏡的檢查，檢查非常舒適，沒有明顯疼痛感。另外在腸鏡檢查前，建議腸道一定要清理干凈再去照腸鏡，否則腸道里黏膜上浮的物質，可能導致結腸鏡檢查看不清。