多數情況下，結膜炎反復發作并不會對眼睛造成實質性損害。極個別情況下，還是會對角膜造成一定的損害。因為結膜位于眼白部位表面一層透明黏膜組織，有豐富的血管，而角膜沒有血管，它的血供來源是角膜緣的血管網。如果結膜炎反復發作，刺激角膜緣的血管網充血，造成角膜邊緣的免疫反應增強，角膜邊緣新生血管增生，最終導致角膜渾濁。這才是結膜炎反復的危害所在，但只是極個別病例。結膜炎反復發作，最主要的損害體現在個人的主觀感覺上，會造成眼睛癢、怕光、流淚、干眼。結膜包括眼球正表面的球結膜，在上下眼瞼有瞼結膜。如果結膜炎反復發生，會造成眼睛不適、有異物感，但實際并沒有異物存在。