尿液呈褐色一般多不考慮食物和藥物的影響，因為食物和藥物的引起來的尿色改變通常色淡，而褐色的尿液首先考慮是存在有血尿。血尿的時候可以看到鏡下有大量紅細胞的存在，血尿發生了以后，應當對血尿發生的原因進行追查。血尿發生的原因非常復雜，有泌尿系統問題。泌尿系統如果出問題，內科性的問題通常見于急慢性腎小球腎炎、間質性腎炎和IgA腎病。外科性的問題主要見于泌尿系統的炎癥、結石、結核、腫瘤、畸形、損傷以及血管問題，幾乎涵蓋絕大多數的泌尿外科疾病。其他可以引起血尿的疾病還包括心臟病、血液病、自身免疫病、嚴重的感染、男女生殖系統問題，還有藥物性的血尿以及運動性血尿。另外一種可能就是出現血紅蛋白尿或者肌紅蛋白尿，尿液中出現血紅蛋白或者肌紅蛋白的時候，尿液可以表現為濃茶色、紅葡萄酒色或者醬油色。血紅蛋白尿主要是見于各種嚴重的血管內溶血，比如溶血性貧血、血型不合輸血以及陣發性睡眠性血紅蛋白尿癥。肌紅蛋白尿主要見于擠壓綜合征，以及缺血性肌壞死，有的時候劇烈運動也會造成肌紅蛋白尿的發生。所以對于褐色的尿，通常要結合伴隨癥狀以及輔助檢查來明確診斷，然后對因進行治療。