混合生殖細胞瘤一般都是惡性的。生殖細胞腫瘤分六類，只有成熟畸胎瘤是良性的，如果有其它成分都是惡性，如含有滋養層細胞的絨癌成分，或原始的含有內胚竇成分，以及生殖細胞的純生殖成分都是惡性。如果混合的是生殖細胞瘤混合絨癌的成分，或者畸胎瘤合并內胚竇瘤的成分，一般都是惡性。惡性腫瘤的治療是綜合性治療，如先放療、化療后再手術，或者手術后再放療、化療。混合都是惡性的，預后相對較差。治療效果要看是何成分居多，如果純生殖細胞瘤成分居多，混合成熟畸胎瘤的組合，預后相對較好，手術把成熟畸胎瘤的成分全部切除就可以。