腎囊腫一般是由膨大的腎小管導致的，腎小管進一步膨大以后，就會導致腎囊腫，導致腎囊腫的原因：1、遺傳：常見的就是遺傳，腎囊腫雖然不是一種明確的遺傳性疾病，但是和遺傳還是有一定關系，特別是多囊腎的病人，和遺傳有明確關系；2、腎小管的畸形：病人會有一些腎小管的畸形，這種畸形的腎小管容易導致腎小管的憩室，腎小管的憩室進一步膨大以后，就會導致腎囊腫的發生；3、感染、腎結石、腎結晶：病人可能合并感染，或者腎結石、腎結晶等，這種感染或者腎結石、腎結晶，對于腎小管也有一定影響，這個時候病人也可能會出現腎小管膨大以后，導致腎囊腫的發生；4、細胞因子：表皮上生長因子或者胰島素樣生長因子比較高的時候，這個時候病人腎囊腫的形成和腎囊腫長大的速度可能都比較快。