如果腎部囊腫＜5cm×5cm，且患者無自覺癥狀，可不予處理。如果囊腫＞5cm×5cm，因為腎臟包膜彈性較差，囊腫大可增加腎臟壓力，影響腎臟結構，也可能出現身體不適。此時患者可考慮B超引導下腎囊腫穿刺或外科手術，多囊腎通常不采用此方式，患者需早期進行藥物治療。有家族性多囊腎病史患者需進行早期監測，定期觀察。 單個或多個腎囊腫應定期監測，即在半年到一年檢查一次B超，同時自行觀察身體狀況，確認有無明顯不適，尤其注意腰部有無癥狀。患者需盡量避免外力撞擊，否則可能導致囊腫破裂，如果出現感染征象，則必須進行抗感染治療。