腎小管上皮細胞空泡變性，說明腎小管上皮細胞受到了損害，在腎臟內科最常見的受到損害的原因有三種，具體如下：1、大量蛋白尿：大量蛋白尿漏出以后，腎小管上皮細胞就要充分回吸收這部分漏出的蛋白質，因為這是機體自我保護反應，當過度的吸收漏出蛋白質以后，腎小管上皮細胞就會發生空泡變性，過多就會造成蛋白復合性腎病，從而出現腎小管的損害，某些腎病綜合征的患者，大量的蛋白尿容易出現急性腎功能不全，也就是這部分原因起到部分作用；2、大量利尿：大量利尿的時候，血中的鉀離子大量通過腎小管漏出，同時某些利尿劑對腎小管上皮細胞可能產生毒副作用，這個時候腎小管上皮細胞可能出現空泡變性，又或者低鉀血癥造成的腎小管上皮細胞空泡變性，這個時候就可以從相應的尿液、血液以及用藥病史上進行鑒別診斷，也可以造成腎小管上皮細胞的損害；3、某些疾病：某些疾病造成的腎小管損害，系統性疾病常見，如干燥綜合征和系統性紅斑狼瘡。