陰莖根部皮膚瘙癢且出現小結節，與諸多因素有關，常見原因如下：1、陰虱：患者發生陰虱感染時，由于陰虱在陰莖根部繁殖導致局部皮膚出現結節，結節表面甚至可出現虱卵現象；2、疥瘡結節：當患者出現疥蟲感染時，可能導致陰莖根部皮膚出現疥瘡結節，表現為局部奇癢難忍并伴隨手指縫與大腿內側局部瘙癢癥狀；3、真菌感染：如果患者發生白色念珠菌感染時，也會導致患者陰莖根部皮膚出現紅疹、紅斑和局部小疙瘩，且表面出現脫皮、脫屑、反復瘙癢等癥狀。患者出現上述癥狀時應及時到泌尿外科或男科就醫，通過局部檢查以明確有無真菌感染、陰虱感染，若皮膚出現小疙瘩和發紫現象，應通過局部檢查排除疥瘡結節感染可能。