尿道感染時，根據病原微生物的不同，治療也不同。如果是細菌感染，可以應用阿莫西林進行治療，尿道感染可分為非特異性感染、特異性感染，非特異性感染通常是普通細菌感染，此類細菌感染可以用阿莫西林進行治療。特異性感染中最常見的是淋球菌性尿道炎，目前推薦的是頭孢曲松、頭孢克肟、喹諾酮類的左氧氟沙星。如果不能除外支原體和衣原體感染，建議加用阿奇霉素、多西環素，而阿莫西林可以作為替代方案進行治療。如果其他藥物不能使用，也可以用阿莫西林進行治療。非淋菌性尿道炎也就是支原體和衣原體引起的尿道炎，應用阿莫西林無效。可以用阿奇霉素、多西環素、喹諾酮類藥物，如左氧氟沙星，也可以應用于非淋菌性尿道炎的治療。同時治療尿道炎，還要注意多飲水、休息，避免勞累，戒除酒精、辛辣的食物。暫停性生活，處理好自己的隨身衣物，性伴侶也要同時治療。